如何選擇合適的DNA提取試劑盒？

實(shí)驗(yàn)室工作中，經(jīng)常會需要用到純化的DNA，這時我們通常需要使用一個商業(yè)的DNA提取試劑盒對目的DNA進(jìn)行分離純化。那么我們該如何選擇合適的DNA提取試劑盒呢？讓我們一起來看看吧！

一、試劑盒組分

目前大多數(shù)DNA提取試劑盒遵循相同的基本步驟: 裂解，柱純化，洗滌雜質(zhì)，柱洗脫。然而，不同的盒子在完成每個步驟的方式上有很大的不同。

二、使用的樣本類型

不同的DNA來源有不同的試劑盒，從實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的細(xì)胞，到臨床樣本，土壤樣本，甚至指紋，也有許多專門用于某些應(yīng)用的試劑盒。

例如，土壤中的腐殖酸或血液中的血紅蛋白會污染純化的DNA，從而干擾下游的DNA實(shí)驗(yàn)（如PCR）。當(dāng)然，也有一些試劑盒會在進(jìn)行純化步驟之前專門去除這些組分。

如果想從PCR或瓊脂糖凝膠中純化DNA，有許多方法可以提高瓊脂糖凝膠純化的回收率。

三、基因組與質(zhì)粒DNA提取

一般來說，質(zhì)粒DNA分離要比基因組DNA分離溫和。這是因?yàn)獒槍|(zhì)粒DNA的裂解步驟需要染色體DNA與細(xì)胞蛋白片段保持結(jié)合，以防止其污染最終的樣品。

兩種類型的DNA回收都有試劑盒，甚至有可以同時純化基因組DNA和總RNA的試劑盒。

四、細(xì)胞系與生物體

在選擇DNA提取試劑盒時，最重要的變量可能是你所使用的生物體。

1. 細(xì)菌：

許多試劑盒都有用于細(xì)菌DNA分離的不同成分，這些試劑盒之間的主要區(qū)別在于細(xì)胞是如何被分解的，因?yàn)橛行┘?xì)菌比其他細(xì)菌更更有挑戰(zhàn)性。

例如，形成生物膜的細(xì)菌可能比傳統(tǒng)的基于去垢劑的方法需要更強(qiáng)的裂解技術(shù)。

2. 動物組織：

用于動物組織DNA分離的試劑盒通常具有更溫和的裂解技術(shù)，因?yàn)榇蠖鄶?shù)動物細(xì)胞不像細(xì)菌細(xì)胞那樣有細(xì)胞壁。

然而，動物組織DNA提取的挑戰(zhàn)往往在于選擇合適的組織勻漿方法。此外，許多動物DNA純化試劑盒不使用苯酚/氯仿萃取或乙醇作為沉淀步驟，以減少破壞DNA的風(fēng)險。

3. 植物：

當(dāng)涉及到植物DNA分離時，必須考慮到其他一些因素，需要注意污染物的去除。

植物在純化過程中通常含有未分離的糖，因此，洗滌劑選擇性地與DNA結(jié)合并從溶液中析出，通常是先將洗滌劑溶解在高濃度的鹽溶液中，然后提取DNA。

4. 血液：

由于技術(shù)上的許多最新進(jìn)展，血液DNA分離試劑盒中有多種裂解技術(shù)和提取方法可供選擇。從血液中分離出的DNA將在很大程度上決定你使用的裂解和提取的類型。

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